Paralelně s aktivitami v mnohostranných vztazích věnuje ERÚ zvýšenou pozornost rozvoji regionální a bilaterální spolupráce. V rámci regionální spolupráce zaujímá prominentní místo Visegrádská skupina (V4).
Bilaterální projekty
Na bilaterální úrovni se v posledních letech odehrála setkání mezi ERÚ a ANRE (rumunským regulátorem), FERC (Federal Energy Regulatory Comission, USA), a dále Rakouskem, či Gruzií. Mezi společnými projekty lze vyzdvihnout spolupráci s lotyšským regulátorem (SPRK) v otázkách teplárenství a projekt TAIEX.